在九月份的癸巳日，之前，在乌阑布通之战中，内大臣公佟国纲在战场上阵亡。当他的遗体被运回时，皇帝命令皇子率领大臣们去迎接。所有在战场上阵亡的官员，都按照他们的官职和贡献程度，得到了不同等级的奠仪和抚恤。戊申日，皇帝决定停止今年的秋决（即秋季的死刑执行）。壬子日，皇帝解除了民间养马的禁令。
冬季十月的己未日，皇帝的病情稍微好转，他召集了大学士等官员到乾清宫进行轮流觐见。乙亥日，皇帝任命鄂伦岱为汉军都统。辛巳日，由于领翰林院学士张英对编修杨瑄撰写的佟国纲祭文失察，祭文内容不当，张英被削去礼部尚书的职位，而杨瑄则被革职并发配边疆，编入旗籍。
十一月的己亥日，皇帝任命熊赐履为礼部尚书。甲辰日，达赖喇嘛请求给皇帝上尊号，但皇帝没有同意，并拒绝了他们的贡品。己酉日，裕亲王福全等人回到京城接受审查。经过王大臣的商议，皇帝对他们给予轻罚，并对将士们进行了叙功。
十二月的丁丑日，皇帝去祭拜陵墓，为孝庄文皇后举行了三年致祭礼。庚辰日，皇帝返回京城。
这一年，皇帝免除了直隶、江南、浙江、甘肃等省三十二州县因灾害而需要缴纳的赋税，具体减免额度有所不同。同时，朝鲜也向朝廷进贡。
辛未年的春正月戊申日，皇帝封阿禄科尔沁贝勒楚依为郡王，以表彰他在与厄鲁特人的战斗中受伤被俘后不屈不挠并最终逃脱归来的英勇事迹。同时，他所属的十二旗中阵亡的台吉都被追赠为一等台吉，并赐予达尔汉的称号，这个称号可以由他们的子孙继承。噶尔丹再次侵袭喀尔喀地区。皇帝命令瓦岱为定北将军，驻守张家口；郎谈为安北将军，驻守大同；川陕总督会同西安将军在宁夏驻兵以备战。同时，命令在籍的勇略将军赵良栋参与军事事务。乙卯日，皇帝任命马齐为兵部尚书。
二月的丁巳日，出现了日食现象。乙丑日，皇帝亲自主持经筵。他命令步军统领领导巡捕三营，并兼任五城督捕的职责。戊午日，厄鲁特人的策旺阿拉布坦派使者前来，他是噶尔丹的侄子。皇帝厚待了他的使者，并在使者返回时，派遣郎中桑额护送他。
三月的戊子日，完成了《通鉴纲目》的翻译工作，皇帝亲自撰写了序文。己酉日，皇帝赐予戴有祺等一百四十八人进士及第或出身的荣誉，具体等级有所不同。
夏季四月的戊午日，左都御史徐乾学向山东巡抚钱钰发送私人信件，此事被揭发后，两人都被革职。丁卯日，皇帝因为喀尔喀部落归附朝廷，亲自到边境地区进行安抚。这一天，皇帝启程前往边境。
五月的丙戌日，皇帝驻扎在多罗诺尔。喀尔喀部落的使者前来朝见。之前，喀尔喀的土谢图汗受到哲卜尊丹巴的蛊惑，杀害了同族的紥萨克图汗得克得黑墨尔根阿海，导致内部纷争不断，最终被厄鲁特人利用。现在，皇帝派遣大臣去调查此事。土谢图汗和哲卜尊丹巴都上书请罪。皇帝赦免了他们。鉴于紥萨克图汗是七旗的首领，皇帝命令他的弟弟策旺紥布继承汗位，并封为亲王。丁亥日，皇帝在行宫接见土谢图汗和哲卜尊丹巴，他们俯首请罪。大臣们宣布了皇帝的赦免令，他们感激涕零地接受了恩赦。皇帝赐给他们茶水和宴席，并让他们入座。在盛大的音乐声中，他们行了九叩首的大礼后退出。戊子日，皇帝再次召见土谢图汗、哲卜尊丹巴、策旺紥布、车臣汗以及喀尔喀各部的济农、伟徵、诺颜、阿玉锡等三十五位大台吉，赐给他们宴席。
皇帝说：“我希望更深入地了解你们，所以再次设宴款待。”并赐予他们官服。因为策旺紥布年幼，所以赐予他皇子的衣帽和数珠。由于车臣汗的叔叔紥萨克济农纳穆紥尔曾劝车臣汗带领十万人归顺，他作为倡导者，请求按照四十九旗的例子给予特殊待遇，这非常值得嘉奖，因此允许他继续担任紥萨克，去掉济农的称号，并封为郡王。其他人则按不同情况封爵。
皇帝向喀尔喀人传谕说：“你们曾经极度困苦，互相抢夺，现在我已经拯救并养育了你们。现在你们将与四十九旗一起，被编入各地的紥萨克，接受管辖和监督。你们必须各自遵守。如果再敢胡作非为，我将依法惩处。”皇帝亲自骑马阅兵，射箭时十发九中。在阅兵满洲兵、汉军兵和古北口兵时，列阵鸣角，鸟枪齐发，声音震动山谷。喀尔喀人看到后都惊讶地说：“真是神威啊！”科尔沁喀尔喀各蒙古的王贝勒请求为皇帝上尊号，但皇帝没有同意。
皇帝又巡视了喀尔喀的营寨，并赐予他们牛羊以及帮助那些穷困的人。接着，皇帝又命令官员去编排喀尔喀的佐领，并给他们提供游牧的地方。乌珠穆秦台吉车根等人因为投降厄鲁特而被按实罪惩处。
六月份，皇帝任命李天馥为吏部尚书，陈廷敬为刑部尚书，高尔位为工部尚书。
七月份，西安将军尼雅翰奉命迁移巴图尔额尔克济农到察哈尔，但济农害怕迁移而逃走，尼雅翰追赶不及，便按罪论处，并命令总督葛思泰去追捕他。朝鲜的使者因为购买一统志而在其国内被判罪。退休的大学士杜立德去世，皇帝赐予他祭葬，谥号文端。
闰七月份，葛思泰上疏报告说济农的弟弟博济在昌宁湖被总兵柯彩派兵击败，并生擒博济和前被禁的格隆等人，他们都被斩首。乙亥日，皇帝巡视边疆。
九月份，皇帝返回京城，途中经过遵化，谒见了孝庄山陵和孝陵。庚午日，任命公阿灵阿为蒙古都统。甲戌日，命令侍郎博济、李光地、徐廷玺与靳辅一同去视察黄河。
十月份，谢尔素地区的盗贼杀害了参将朱震，西宁总兵官李芳述擒获了盗贼首领华木尔加并将其诛杀。癸巳日，任命巴德浑为满洲都统，杭奕禄为荆州将军。丁未日，甘肃提督孙思克讨伐阿奇罗卜藏，并将其斩首。之前，出使厄鲁特的侍读学士达虎在返回嘉峪关途中被阿奇罗卜藏所害，皇帝命令孙思克讨伐他。这时传来了捷报。
十一月份，皇帝任命索诺和、李振裕为工部尚书，任命伊勒慎为满洲都统。己未日，皇帝下诏说：“我崇尚德教，消除繁琐的苛政，大小官员都受到我的恩宠和礼遇。即使因为某些事情被罢免，我也仍然让他们能在家乡安度晚年。但近来有些人因为私怨而争斗不休，甚至形成了党同伐异的恶习，难道你们想重蹈明朝末年门户之争的覆辙吗？我希望你们都能摒弃私怨，共同致力于忠诚和公正。如果有执迷不悟的，我一定会严惩不贷。”当时徐元文、徐乾学、王鸿绪已经被罢免，而傅腊塔等人还在挑拨离间，兴风作浪，所以皇帝特别下诏警告他们。甲戌日，皇帝又下诏说：“钦天监报告说明年正月初一将有日食。这是上天示警，我非常害怕。因此，我决定取消元旦的筵宴等礼仪。各位官员应该恪尽职守，帮助我修身反省。”
在十二月的甲申日，皇帝发布了一道诏书：“我治理天下，始终以爱护和养育百姓、让他们过上安定富裕的生活为念。近年来，地方上的田赋和人头税已经多次减免，但每年运送漕粮的任务仍然存在，这让我时刻感到忧虑。除了河南已经减免外，湖广、江苏、浙江、安徽、山东等地的漕粮也将依次减免一年，以减轻百姓的负担。”在丁亥日，朝廷还调动旗庄的壮丁前往古北口外的达尔河开垦田地。同时，朝廷还派遣侍郎阿山、德珠等人前往陕西监督赈灾工作。壬辰日，皇帝命令总督、巡抚、提督、镇守等官员推荐有能力、有功绩的武职官员，在内八旗的旗员则由都统等人举荐。
这一年，直隶、江南、江西、河南、山东、陕西、湖广、云南等省的一百八十八个州县因为灾害而减免了不同数量的赋税。朝鲜、安南、琉球等国家也向朝廷进贡。
三十一年壬申春正月辛亥日，因为日食的出现，免除了朝贺。甲寅日，皇帝在乾清门展示了太极图、五音八声八风图，并指出《律吕新书》中的“径一围三”之法并不准确，应该是“径一尺围当三尺一寸四分一厘”，如果累积到百丈，误差就会达到十四丈之外。他还指出，只有“隔八相生”的说法经过试验是符合的。此外，他还讨论了河道闸口的流水量，并展示了测日晷表，验证其准确性。大臣们对此都表示信服。庚午日，皇帝前往南苑打猎。
二月辛巳日，任命靳辅为河道总督。乙酉日，因陕西旱灾，朝廷发放山西的国库银两和襄阳的粮食进行赈灾。丁亥日，皇帝巡视京畿地区。辛卯日，因赈灾不实，陕西巡抚萨弼被免职。戊戌日，皇帝返回京城。己亥日，皇帝主持经筵。乙巳日，任命马齐为户部尚书。
三月丙辰日，朝廷派遣内大臣阿尔迪、理藩院尚书班迪前往边境设立蒙古驿站。乙丑日，任命府丞徐廷玺协助管理河工。加封甘肃提督孙思克为太子少保，并赐予世袭官职。退休的大学士冯溥去世，朝廷赐予祭葬，谥号文敏。任命阿席坦为满洲都统。在云南设置永北镇。
四月庚辰日，任命希福为满洲都统，护巴为蒙古都统。己丑日，朝廷发放一百万两帑银赈济陕西，并派遣尚书王骘、沙穆哈前往视察并增加赈灾力度。戊戌日，皇帝前往瀛台，召集近臣观赏稻田和种植的竹子。河道总督靳辅请求在新庄、仲家浅各建一闸，朝廷下令讨论并执行。
五月庚寅日，皇帝命令户部，山西平阳丰收，可以派遣官员购买粮食以备荒年。任命王维珍负责此事。癸卯日，朝廷将喀尔喀部划分为三路，即北路土谢图、东路车臣、西路紥萨克图，各属部按照其分地划分为左右翼。
六月庚辰日，任命宋荦为江宁巡抚。乙未日，蒙古科尔沁部落进献锡伯、卦尔察、打虎尔一万多户人家，朝廷给予银两作为酬谢。
七月乙亥日，皇帝巡视塞外。
八月己丑日，朝廷任命翁叔元为刑部尚书，博济为西安将军，李林隆为固原提督，李芳述为贵州提督。
九月戊申日，噶尔丹的属下抓住并杀害了我国的使臣马迪。庚戌日，皇帝返回途中停留在汤泉。己未日，皇帝返回京城。丁卯日，皇帝主持经筵。壬申日，皇帝在玉泉山进行了盛大的阅兵。
十月己卯日，皇帝发布诏书：“陕西省近年来遭受严重的灾害和疾病，虽然经过多方赈济，但积困仍未消除。因此，决定免除明年所有地丁税粮，并一概豁免之前的欠款。这体现了朕对百姓的深厚关爱。”庚辰日，任命李天馥为大学士。壬午日，皇帝前往陵墓拜谒。特别赦免陕西地区除十恶及军前获谴者外的所有罪犯，一律免死减一等。任命佛伦为川陕总督，宗室董额为满洲都统。庚寅日，皇帝返回京城。癸巳日，任命熊赐履为吏部尚书，张英为礼部尚书。庚子日，停止直省进献鲜茶和赉送表笺。
十一月庚戌日，任命阿灵阿为满洲都统。甲寅日，命令熊赐履勘察淮、扬滨河地区的干涸田地。丙寅日，加封孙思克为振武将军。任命觉罗席特库为蒙古都统。
十二月壬午日，河道总督靳辅去世，朝廷赐予祭葬，谥号文襄。任命于成龙为河道总督，董讷为左都御史。壬辰日，任命郎化麟为汉军都统。辛丑日，因西安饥荒，朝廷从襄阳运送粮食进行平价销售。加封希福为建威将军，并调他驻守右卫。召见科尔沁蒙古王沙津入京，当面授予他机宜，让他诱使噶尔丹归顺。
这一年，朝廷免除了陕西、江南、四川等省十三州县因灾害而减免的不同数量的赋税。朝鲜也向朝廷进贡。
三十二年癸酉春正月甲子日，皇帝发布诏书，命令朝鲜永久停止每年进贡黄金和木棉。
二月乙亥日，朝廷发放国库银两，招募商贩到西安平价销售粮食。丙子日，派遣内大臣坡尔盆等人前往归化城监督三路屯田。同时，皇帝下诏修缮南河周桥堤工，这是往年靳辅与陈潢所规划的项目，现在由阅河大臣绘图进呈，皇帝特别下诏进行修缮。策旺阿拉布坦派遣使臣入贡，报告使臣马迪被害及噶尔丹的密事，朝廷赐予他彩缎作为奖赏。癸未日，皇帝主持经筵。同时，朝廷决定将宣府六厅十卫改为一府八县。戊子日，任命郎谈为昭武将军，与阿南达、硕鼐一起率兵前往宁夏，将军博济、孙思克参与军事决策。庚寅日，皇帝巡视京畿地区，检查了霸州苑家口的堤工，并命令巡抚郭世隆进行修缮。庚子日，皇帝返回京城。贵州巡抚卫既齐因上报剿办土司情况不实，被夺职并戍守黑龙江。