高第也知自己失言，又把觉华岛的事情说了一遍：”臣初闻奴报过河，即檄觉华岛将官凿冰自卫，乃风雪严寒，冰开复合，奴兵猝至，将多死之。焚龙宫寺米豆二十数百有奇。“天启皇帝于是让高第把粮料、船只、器械的损失及应罪、应恤人员，调查清楚后再来汇报。
兵部尚书王永光是个谨慎的人，他以为贼锋虽挫未可恃也，宜于九边重镇中抽定精锐，成立机动部队有兵部调遣言：”今酌定马步数目，令遵前旨，预备以待。如保定镇原为京陵，宜调马兵六千、步兵二万；宣、大各有边防，宜各调马兵五千；山西马匹原少，宜调步兵六千；河南、山东兵数虽少，亦各调步兵二千；而延绥于诸陕为近，亦宜预备马兵四千。合成马兵二万、步兵三万。盖抚镇各急其地，每以防守为辞，遇有征调，多不应手。今关报孔棘，诸臣谊切同仇，宜将所定兵数，于原额内外酌量抽添，另立一营，专备臣部拨遣。“
天启皇帝也同意王永光的提议，着行各该抚镇，立营操练，专备不时征调。勿因贼退怠缓，待东事尽平，方许具奏停止。
山西道御史高弘图上奏，狠拍了天启皇帝一记马屁：”奴酋騺伏四年不动，一朝突至，宁远被围，举国汹汹，一重门限，岂是金汤？自袁崇焕有死地求生、必死无生之气，则莫不翕然壮之。然自有辽事，用兵八年不效，固未敢逆料，其果能与贼相持、与城俱存否也？是以深轸圣怀，时切东顾，甫采盈庭之方略，辄得马上之捷书。然后知从前无不可守之城池，而但无肯守之人与夫必守之心。今崇焕称必守矣。……“
左都御史周应秋一方面拍皇上马屁，一方面建议加强宁远的防守：”奴酋大举过河攻宁远，几震京师。幸仗皇上之威灵，袁崇焕之方略，将士奋击，贼负重伤遁去。夫狡虏向者轻我，今者惧我矣；轻则犹可抵，惧则不可狃。合无一面发关兵遣剿，一面令巡关御史，严饬各边道将，加意防卫。觉华岛与宁远相对匪遥，当预宿重兵，以备堵截。至于宁远，须预置兵万余于城；或令关上挑选，或令崇焕召募土着，然后关门内神京可恃以无恐，而辽疆恢复有基矣。“此疏果然得到天启皇帝近来法纪渐明、深禆宪纲的好评。
经略高第向皇上报告了建虏的最新动态：“奴贼初九日分三枝，一枝由傅家庄，二枝由西宁堡、三岔河渡口过河，初十日尽数过；奴贼哨马在大凌河、右屯卫一带活动，千总曹恭诚、于子章巡视时突遇之，稍有斩获。”
天启皇帝仍想彻底解决建虏，使其不能在辽东立足：“奴酋久恋河西，狡计叵测。仍宜相机驱逐，以保万全。亟修战守，实事以备将来，不得以贼退怠缓。”
大学士顾秉谦等人提出要加强执法力度：“昨晚接经略高第塘报，奴贼溃败东归，已于初十日尽数过河去讫。臣等伏思，奴贼自抚顺发难，于今九年。彼大入大利，小入小利，辽沈、广宁相继陷失；而我兵非望尘奔北，则闻风先逃，曾不能以一矢加遗。以中国之全力，而屈于一隅之丑虏，岂强弱之势殊哉。法不立，诛不必，文武不和，调度无法，故鲜克济耳。……”
经略高第弹劾中部总兵杨麒在宁远之战中懦怯不前，不敢救援宁远；天启皇帝果然革去杨麒的职务，并命以后中部总兵驻扎前屯卫，与宁远相为应援。如退回关门，以擅离信地论，轻则革职，重则尚方剑伺侯。
宁远一役击伤老奴，击退建虏后，宁远参政袁崇焕成为朝野中的大红人，然而此时的他却萌生了“急流勇退”的想法，提出辞职并陈述善后事宜：“请以十万五千官兵汰为八万，以二万留关内，六万布关外。宁远添二辅城以为犄角，各堡增设铳台以为应援；而宁远以东仍安哨探，令就地为耕，有事仍收还宁远。南兵脆弱，西兵善逃，莫若用辽人守辽土。将官则辽东一总兵，关内一总兵，余皆赘也。”
袁崇焕一方面提出裁减兵将，增设铳台、宁远增设辅城；一方面仍视宁远以东为哨探之地，防御重心仍然以宁远为中心：“若夫宁远幸存，总兵满桂实司提调，副总兵左辅、参将祖大寿与中军守备何可纲，坚执塞门死守之议。其分部士民炊饭饷兵、使得一意攻打，则通判金启倧之力。而西虏乘间作贼，得赵率教大创之。满桂、赵率教业已加级，左辅、祖大寿、何可纲、金启倧应各加级，以励将吏。其他与事者，俱冒石矢、当锋镝，升赏总不宜迟。”
袁崇焕此前曾经以丁忧为名，向天启皇帝连上三疏请辞，他上第一疏的时间是天启四年十月十二日;宁前等处兵备管屯田马政，山东布政司使司右参政兼按察司佥事今丁忧。袁崇焕为君恩当报，子道难亏，伏乞圣明俯容守制以重彝伦，以崇孝治事。该臣以宁前道于前月二十二日接家报，臣父子鹏于七月初五日以疾殁于里门，当即申报督抚，随蒙抚院批允，印交关内道副使刘诏署掌，臣即移会户部管饷员外唐登俊及关内道，又牌行各厅陆运同知毛宗苌等，查有本道经批不明钱粮，可乘道在任查明，随经员外唐登俊等回称：并无不明钱粮，各厅俱有甘结，随即粘连印结，申报各督抚饷关衙门。。。。。。。
天启皇帝不肯放袁崇焕的假，诏曰：“封疆重任，袁崇焕着遵前旨供职，不必再陈。该部知道。”
可是袁崇焕却不肯罢休，十月十五日，他又上了《再乞守制疏》：“臣于本月十二日奏为君恩当报，子道难亏，伏乞圣明，俯容守制，以重彝伦，以崇孝治事。”
这次，天启皇帝不但不批假，反而把他训斥了一顿：“袁崇焕身任疆场，本朝原有起复故事，如何坚求守制？显是避难推诿。姑不就还着遵屡旨行，不必再来渎扰。该部知道，钦此。”